Es lo habitual pensar en la creación de una institución en términos de definiciones exactas de objetivos y metas, organigramas, procedimientos y sistemas operacionales. Para FUNDAEC, todos estos arreglos organizacionales fueron evolucionando dentro de la acción y no se formularon con antelación, de acuerdo con una u otra de las teorías en boga de desarrollo organizacional. Como primer paso, el grupo fundador se concentró en un largo proceso de consulta y deliberaciones que le habría de llevar a lograr un grado mínimo de unidad de pensamiento alrededor de una serie de conceptos y principios que guiarían la búsqueda de los caminos alternativos de desarrollo:

1. Considerar a las poblaciones como recursos potenciales, no como problemas.
2. Despertar el potencial humano por medio de una educación apropiada.
3. Reconocer y exaltar la nobleza de la persona humana.
4. Buscar el equilibrio entre las dimensiones del ser humano.
5. Propender por un desarrollo que no se conciba como “modernización” .
6. Comprometerse en la búsqueda del conocimiento pertinente.