Los orígenes de FUNDAEC se remontan a los primeros años de la década de los 70, cuando un grupo de profesionales de variadas disciplinas, preocupados por los efectos negativos de los procesos de desarrollo puestos en marcha después de la II Guerra Mundial, en sus frecuentes deliberaciones esbozaron lo que sería un modelo de desarrollo integral para las poblaciones rurales, sustentado en una participación verdadera de sus habitantes. El grupo era liderado por Farzam Arbab, un físico renombrado que había llegado como profesor visitante a la Universidad del Valle en 1970.